研究报告

绶草的遗传多样性及地理分布格局分析  

莫忠妹1 , 杨传东1 , 李银双3 , 赵财2*
1 铜仁学院, 贵州省梵净山地区生物多样性保护与利用重点实验室, 铜仁, 554300; 2 贵州大学生命科学学院, 山地植物资源保护与保护种质创新教育部重点实验室, 山地生态与农业生物工程协同创新中心, 贵阳, 550025; 3 楚雄医药高等专科学校, 楚雄, 675000
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2022 年, 第 20 卷, 第 41 篇   
收稿日期: 2021年09月12日    接受日期: 2021年09月20日    发表日期: 2022年08月05日
© 2022 BioPublisher 生命科学中文期刊出版平台
这是一篇采用Creative Commons Attribution License进行授权的开放取阅论文。只要对本原作有恰当的引用,版权所有人允许和同意第三方无条件的使用与传播。
摘要

利用 NCBI 数据库数据,以绶草叶绿体 matK 序列和核基因 ITS 序列为主要研究对象,对绶草的遗传多样性及地理分布格局进行讨论分析,以期为绶草优良种质资源的遗传多样性评价提供有价值的参考。结果表明:绶草的 matK 序列比对后长度为 512 bpG+C 含量 32.4%A+T 含量 67.7%,序列碱基组成具有明显的 A/T 偏好性,共检测到 7 个单倍型,总单倍型多样性 Hd 0.644,总核苷酸多样性(π)0.003 16。绶草的 ITS 序列比对后长度为 441 bpG+C 含量 55.3%A+T 含量 44.8%,共检测到 15 个单倍型,总单倍型多样性 Hd 0.877,总核苷酸多样性(π)0.007 18,遗传分化系数 Gst<Nst (Gst=0.39<Nst=0.64Gst=0.26<Nst=0.50),说明绶草具有明显的谱系地理分布格局,基因流较低(Nm=0.14, Nm=0.25),失配分析的观测值曲线与期待值曲线都呈下降趋势并且呈现多峰,结合中性检测结果发现绶草物种居群保持稳定,没有发生过近期扩张现象。本研究得出印度、韩国、日本和歌县,中国喜马拉雅山脉地区遗传多样性较高,推测在第四纪冰期时绶草在印度、中国、朝鲜、日本等均可能存在冰期避难所。

关键词
绶草(Spiranthes sinensis);NCBI;谱系地理学;遗传多样性

HTML格式版本正在制作中。
《分子植物育种》印刷版
• 第 20 卷
阅览选项
. 全文 PDF
. 全文 HTML
读者评论
. 评论
作者的其他论文
.
莫忠妹1
.
杨传东1
.
李银双3
.
赵财2*
相关论文
.
绶草(Spiranthes sinensis)
.
NCBI
.
谱系地理学
.
遗传多样性
服务
. 发表评论